Σε μια δραματική εξέλιξη, ο στρατός στη Γουινέα-Μπισσάου πήρε τον έλεγχο της χώρας, διακόπτοντας τη δημοκρατική διαδικασία και αναγκάζοντας τον πρόεδρο να φύγει στο εξωτερικό. Η στρατιωτική επέμβαση έγινε λίγες μέρες μετά από προεδρικές εκλογές που είχαν πολλές αντιδράσεις, και αποτελεί το πιο πρόσφατο επεισόδιο στην ταραγμένη πολιτική ζωή αυτής της δυτικοαφρικανικής χώρας. Οι στρατιωτικοί δημιούργησαν μια μεταβατική κυβέρνηση, έκλεισαν τα σύνορα και ακύρωσαν τις εκλογές, στις οποίες τόσο ο πρόεδρος όσο και ο κύριος αντίπαλός του ισχυρίζονταν ότι νίκησαν.
Η κρίση ξέσπασε μετά την καταμέτρηση των ψήφων, όταν και οι δύο υποψήφιοι, ο πρόεδρος Ουμάρο Σισοκό Εμπαλό και ο αντίπαλός του Φερνάντο Ντίας, δήλωσαν νικητές. Αυτή η κατάσταση δημιούργησε ένα πολύ δύσκολο πολιτικό πρόβλημα. Την Τετάρτη, στρατιωτικοί εμφανίστηκαν στην τηλεόραση και ανακοίνωσαν ότι παίρνουν τον «πλήρη έλεγχο» της χώρας. Δημιούργησαν μια νέα στρατιωτική επιτροπή για να επαναφέρουν την τάξη, η οποία αμέσως διέκοψε τη διαδικασία των εκλογών.
Κατοικοί της πρωτεύουσας Μπισσάου ανέφεραν ότι άκουγαν πολλούς πυροβολισμούς κοντά σε σημαντικά κυβερνητικά κτίρια. Ο πρόεδρος Εμπαλό, μαζί με έναν στενό συνεργάτη του, πρώτα πήγε στη γειτονική Σενεγάλη και αργότερα ταξίδεψε στην Δημοκρατία του Κονγκό. Ο στρατός κινήθηκε γρήγορα για να καλύψει το κενό εξουσίας, διορίζοντας νέο μεταβατικό πρόεδρο και πρωθυπουργό.
Οι λόγοι για το πραξικόπημα δεν είναι ξεκάθαροι. Κάποιοι ειδικοί πιστεύουν ότι ο στρατός παρενέβη για να αποφύγει μια επικίνδυνη πολιτική κρίση. Άλλοι, όμως, υποψιάζονται ότι ίσως ήταν μια σκηνοθητημένη ενέργεια για να βοηθήσει τον πρόεδρο να επιστρέψει στην εξουσία αργότερα ως σωτήρας. Αυτή η άποψη ενισχύεται από το γεγονός ότι στην πολιτική ιστορία της χώρας, η διαφορά μεταξύ πολιτικών σχεδίων και πραγματικών στρατιωτικών επεμβάσεων είναι συχνά ασαφής.
Η διεθνής κοινότητα καταδίκασε το πραξικόπημα. Ηγέτες από τη δυτική Αφρική και τα Ηνωμένα Έθνη ζήτησαν την άμεση επιστροφή στη δημοκρατία. Ο πρωθυπουργός της Σενεγάλης δήλωσε: «Θέλουμε οι εκλογές να ολοκληρωθούν. Η εκλογική επιτροπή πρέπει να ανακοινώσει τον νικητή». Αυτό το πραξικόπημα – ένα συχνό φαινόμενο σε μια χώρα με τόσα πραξικοπήματα από την ανεξαρτησία της – δείχνει πόσο ασταθής είναι η περιοχή και θυμίζει τις δυσκολίες που αντιμετωπίζει η δημοκρατία. Το μέλλον της Γουινέας-Μπισσάου είναι αβέβαιο και εξαρτάται από το τι θα κάνει ο στρατός και από τη διεθνή πίεση.